Công ty Thủy điện An Khê – Ka Nak là đơn vị hạch toán phụ thuộc Tổng công ty Phát điện 2 (EVNGENCO2), được phân cấp quản lý, có tổ chức bộ máy kế toán riêng. Thông qua việc sử dụng tối đa các giải pháp tổ chức công tác kế toán và quản lý tài chính đã giúp Công ty điều hành hiệu quả các mục tiêu hoạt động, và quản lý chặt chẽ tình hình tài chính. Giúp Công ty tối ưu hóa chi phí theo đúng chương trình thực hành tiết kiệm, chống lãng phí của EVN và EVNGENCO2.